Primeiro entre no diretório onde você armazena os códigos-fonte baixados. Uma sugestão é usar o diretório /usr/local/src.

# cd /usr/local/src

Depois baixe com o wget:

# wget http://ufpr.dl.sourceforge.net/sourceforge/nagios/nagios-3.0.2.tar.gz

Descompacte o arquivo baixado:

# tar -zxvf nagios-3.0.2.tar.gz

Entre no diretório nagios-3.0.2:

# cd nagios-3.0.2

Em seguida execute a seguinte sequência de comandos:

# ./configure --with-command-group=nagcmd
# make all
# make install
# make install-init
# make install-config
# make install-commandmode

E por último, o webconf para criar o arquivo necessário para o Apache:

# make install-webconf

Criando uma conta de usuário para o Nagios:

Lembrando que a primeira conta tem que ser o nagiosadmin, depois pode-se criar outros usuários sem muitas permissões.

# htpasswd -c /usr/local/nagios/etc/htpasswd.users nagiosadmin

Instalando plugins para o Nagios

Volte ao diretório /usr/local/src:

# cd /usr/local/src

Baixe os plugins utilizando o wget:

# wget http://superb-west.dl.sourceforge.net/sourceforge/nagiosplug/nagios-plugins-1.4.10.tar.gz

Descompactando os plugins:

# tar -zxvf nagios-plugins-1.4.10.tar.gz

Entre no diretório nagios-plugins-1.4.10:

# cd nagios-plugins-1.4.10

Instalando os plugins no Nagios:

# ./configure --with-nagios-user=nagios --with-nagios-group=nagios
# make
# make install