Há vários, em geral leves e simplificados, como o comercial  
MWM (Motif Window Manager),  que tem uma 
modificação de código aberto, o 
Open Motif; o francês 
CTWM (um TWM muito  aumentado e 
melhorado); 
AmiWM, para deixar o micro parecido com os antigos computadores Amiga; o 
PekWM, altamente configurável, o 
Ion, um gerenciador de janelas todo controlado por atalhos de teclado etc.
Por serem importantes ou muito bons, podemos destacar mais alguns.
a) Merece um destaque especial o 
Antico! É um novo ambiente gráfico completo, italiano: 
Leve, somente usa bibliotecas de QT4 e não tem outras dependências gráficas de KDE e GNOME. É completo, mas é rápido 
como se fosse somente um gerenciador de janelas:
Suas janelas e menus assemelham-se um pouco ao LXDE e aos KDEs antigos, porém nos menus, os aplicativos aparecem em 
ordem alfabética, organizados como no GNOME, para facilitar. Deste modo, é bonito como o KDE e prático como o GNOME!
Abaixo, o Antico, instalado em Sabayon 
Linux 4.0r1 (atualizado a 5.0):
Também existe um "Fork" americano do Antico, chamado Antico DeLuxe:
b) O clássico 
SawFish, um gerenciador de janelas totalmente minimalista e que por isso, é altamente extensível, 
podendo ser muito aumentado. O SawFish é frequentemente adicionado como gerenciador principal de janelas no GNOME, em 
substituição ao Metacity, para tornar o GNOME mais rápido.
c) Outro substituto do Metacity para o GNOME é o 
MatchBox, "Caixa de Fósforos". Suas janelas lembram um pouco 
o Windows e os KDEs antigos.
d) 
Eclipse é um gestor de janelas simplificado com um terminal de comandos especial. É totalmente escrito em 
Lisp.
e) Um que era bastante bonito era o OLVWM ("Open Look Virtual Window Manager", gerenciador de janelas virtual de visual 
aberto), mas parece extinto, seus links não mais estão sendo encontrados.
f) Havia também o 
Blanes, um ambiente gráfico desenvolvido para ficar parecido com  Windows!
Hoje é a base de uma distro Debian like simples, brasileira:
g) O 
Mezzo, uma ampliação do FVWM, caracterizada por possuir janelas bonitas, com botões, barras, completas, 
mas sem menus. Deste modo tem características "Sui Generis", por ser maior do que um Box, mas menor do que um gesto de 
janelas completo (E17, WindowMaker etc).
É o padrão em uma distro Linux chamada SymphonyOS.
h) Interessante também é o 
SCWM (Scheme Constraints Window Manager) porque aceita temas e ícones de vários 
outros gestores de janelas e ainda cada janela em separado, pode ter diferente decoração, fundo, transparência etc, cada janela 
pode ficar diferente da outra! 
i) O 
JWM (Joe's Window Manager) especialmente feito para ser muito rápido, usa só uma biblioteca (xlib). Ele é 
quase tão leve quanto um Box, mas não é tão "primário" quanto as telas, isso é, é como se fosse um Box, mas um pouco mais 
elaborado:
Está presente nas novas versões do Puppy Linux e algumas de suas modificações (como o Toutou Linux).
Existem ainda muitos outros! Para conhecer quase todos os ambientes gráficos e gerenciadores de janelas que existem, visite o 
site 
xwinman.org.