Para usar transparências reais e sombras nas janelas e menus, basta instalar o xcompmgr. Não precisa de Compiz, Beryl ou Compiz Fusion.

Para usuários Arch Linux:

# pacman -Sy xcompmgr

Após a instalação, rode:

# xcompmgr -cfF

E pronto =)

Para outros tipos de transparências instale também o "transset".

# pacman -Sy transset

Além dos efeitos já citados de transparência e sombra, o xcompmgr também oferece o efeito de fade-in/fade-out, basta usar -fF como parâmetro.

Fica aí a dica.