Download do Banco de dados NCBI NT (DNA)
Publicado por José Cleydson Ferreira da Silva (última atualização em 19/11/2010)
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Homepage: geminivirus.org
Esse script faz o download do banco de dados do NCBI (Nucleotídeo). Esse banco possui todos os dados referentes a DNA de diversas espécies que já foram decifrados e estão disponibilizados para a comunidade científica de todo o mundo.
#!/bin/sh # Script para download do banco de dados ncbi Nt (Nucleotídio) # 04/10/2010 - Cleysinho # cleysinhonv@gmail.com - twitter @jcleydsonf # Versão 0.1 # Observações: # O processo de download das bases de dados do banco de dados pode ser demorado. echo 'Iniciando Download 00' > status_download wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nt.00.tar.gz echo 'Iniciando Download 01' >> status_download wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nt.01.tar.gz echo 'Iniciando Download 02' >> status_download wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nt.02.tar.gz echo 'Iniciando Download 03' >> status_download wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nt.03.tar.gz echo 'Iniciando Download 04' >> status_download wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nt.04.tar.gz echo 'Iniciando Download 05' >> status_download wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nt.05.tar.gz echo 'Iniciando Download 06' >> status_download wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nt.06.tar.gz echo 'Iniciando Download 07' >> status_download wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nt.07.tar.gz echo 'Iniciando Download 08' >> status_download wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nt.08.tar.gz echo 'Iniciando Download 09' >> status_download wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nt.09.tar.gz echo 'Terminado Download' >> status_download # Fim do script
substituir strings nos nomes de arquivos
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