Para aqueles que, como eu, tem um placa-mãe com saídas VGA, DVI, HDMI e SOM Onboard e se deparam com a necessidade de utilizar tudo ao mesmo tempo. Aqui vai a solução.

Configurando os dois monitores

A nível de informação essas configurações foram feitas no Ubuntu 10.10 (Maverick Meerkat), utilizando placa-mãe Asus M4A88T-V EVO/USB3

Em primeiro lugar não foi instalado o drive vídeo proprietário, pois o mesmo apresentou alguns conflitos quando ouve a necessidade de usar dois monitores.

Partindo para as configurações, devemos configurar as "Preferências do Monitor" para não exibir a mesma imagem, assim desmarcando a opção: "Mesma imagem em todos os monitores".
Após essa configuração em um dos monitores será exibido o Desktop e o outro será a extensão do Desktop. Assim já podendo mostrar programas diferentes nos dois monitores, apenas arrastando-os de um monitor para o outro.

Configurando as duas Placas de Som ao mesmo tempo

Em Preferências de Som deveremos configurar a placa de Saída padrão. Após essa configuração todos os Sons serão direcionados para a placa que foi escolhida como padrão.
Para que seja usada a segunda placa de áudio devemos configurá-la na saída de áudio do programa que iremos utilizar. No caso usamos o VLC porque o mesmo tem escolha de qual placa queremos utilizar.

Configurando o VLC

No VLC devemos ir em Ferramentas -> Preferências -> Áudio -> Opção Saída:

Em módulo de saída escolha: Saída de Áudio ALSA

Em Dispositivo: Escolha o correspondente à sua segunda placa: