Equipamentos ISA-PNP ou ISA não-PNP ainda estão por aí. Se eles atendem ao que você precisa, continue com ele, mas na primeira oportunidade passe tudo para PCI. O ganho e a performance são incomparáveis. Alguma dificuldade para conseguir drivers para equipamentos antigos pode existir, ou mesmo alguma incompatibilidade. No geral funcionam muito bem. A questão é que tornam seu micro mais lento. Não se surpreenda se desativando todo seu hardware legado seu equipamento ficar mais rápido. Somente para lembrar que a freqüência dos dispositivos ISA é 8 MHZ como os primeiros XT e 286, enquanto PCI vai a 33 MHZ no mínimo, podendo apresentar taxas de até 66 MHZ e ainda existem slots PCI de 64 bits (eu nunca vi!) e o barramento PCI Hotplug que permite trocar a placa sem desligar o micro (esse então só nos sonhos!).

Referências bibliográficas

• Curso Completo de Hardware - Gabriel Torres 4a Edição.
• Página de manual lspci, pnpdump, isapnp.

Grato,
Unasi