Para iniciar o servidor, usa-se sempre o comando:

$ hamachi start

Ele irá funcionar em background e você controlará ele pela linha de comando, como mostrado a seguir.

$ hamachi stop (para o servidor)

Se você quiser saber o status do servidor, a qualquer hora você rodar o hamachi sem argumentos e terá uma saída semelhante a esta:

$ hamachi
Hamachi, a zero-config virtual private networking utility, ver 0.9.9.9-20

  version  : hamachi-lnx-0.9.9.9-20
  pid      : 4045
  status   : offline
  nickname : anonymous

Note que o nickname e o status reportam que o sistema não tem uma identidade ainda e está off-line, isto ocorre sempre quando se é a primeira vez que o instala. Para deixá-lo online passe o comando:

# hamachi login (coloca o servidor em estado alive e cria uma conta)

Para desconectar:

# hamachi logout (desconecta da rede, servidor continua alive)

Se até aqui deu tudo certo, é hora de entrar em uma rede, mas é preciso salientar que todas as redes são privadas, assim sendo, você precisa saber o nome da rede seguido de sua senha, porém isto você encontra fácil no Google, basta consultar, por exemplo, "hamachi age of empires ii" ou você pode se conectar à rede do fórum Genova:

Rede: Genova Engine
Senha: 123

Para isto veja os comandos a seguir:

$ hamachi join 'Genova Engine' 123
$ hamachi go-online Genova Engine
$ hamachi list

O primeiro comando fará você entrar na rede, o segundo mostra que você está ativo para os outros membros, caso você não o passe, os outros jogadores acharão que você está off-line e por último e não menos importante, o comando "list" que mostra todos os usuários da rede que você está conectado.

Uma vez logado você criar suas próprias redes usando o comando:

$ hamachi create <rede> <senha>

Assim você será o dono da rede e poderá destruí-la quando quiser, para isto use o comando:

$ hamachi delete <rede>

Para alterar seu nickname use o comando:

$ hamachi set-nick <apelido>

E para uma lista completa dos comandos deste fantástico programa, passe na linha de comando o seguinte:

$ hamachi --help