A escolha de repositórios de pacotes é uma tarefa do administrador de rede que envolve diversos fatores críticos relacionados com o tipo de conexão disponível e os tipos de pacotes que podem ser utilizados no sistema. Caso tenha um acesso direto a Internet será possível utilizar tanto repositórios que usam o protocolo FTP quanto HTTP. Nos casos em que um servidor proxy estiver entre o computador e a Internet é preciso saber qual o tipo de serviço oferecido pelo proxy.

Nestes casos, os repositórios serão limitados pelo tipo de conexão disponível na rede. Nos casos de redes com muitos computadores a melhor opção é montar um repositório local. Isto economiza banda na conexão e alivia a carga nos repositórios. Repositórios são comumente bastante lentos por diversos fatores, sendo o número de usuários simultâneos o principal deles. Então, colabore sempre para manter a carga baixa nos repositórios. A lista de repositórios oficiais normalmente é encontrada no portal Internet do distribuidor oficial.

Determinado o tipo de conexão, a escolha agora é sobre os tipos de pacotes que serão usados. Esta escolha vai variar entre as distribuições já que tipos diferentes de pacotes podem estar armazenados em diferentes repositórios. Basicamente, se oriente sobre os tipos de pacotes que estão disponíveis para sua distribuição e escolha aqueles que mais se adaptem ao tipo de instalação e a finalidade do seu computador. Prefira os repositórios de pacotes estáveis e oficiais.