Consegui deixar o Metacity com o sloppy focus, ou seja, o foco é dado para a janela que o mouse vai e a janela só é passada para frente (raise) das outras quando você clica com o mouse na barra de título ou segura o <alt> e clica na janela, como é no Enlightenment.

Sigas os passos. No terminal:

$ gconf-editor (não precisa estar como root)

Vá na pasta: apps --> metacity --> general

E troque as opções abaixo:

• focus_mode: sloppy
• focus_new_windows: smart
• raise_on_click: off