Para adicionar extensão aos arquivos que não as possue, use o comando: rename (ou prename, dependendo da distro) da seguinte forma:

rename 's/(.+)/$1\.EXTENSÃO/' DIRETÓRIO/*

Exemplo: Para adicionar a extensão '.jpg':

rename 's/(.+)/$1\.jpg/' /home/user/imagens/*

Obs.: Note que não há distinção dos tipos de arquivos, ou seja, todos os arquivos, ao final, terão '.jpg' como extensão, independente de serem ou não imagens!

Ah, se no diretório de destino existirem outros arquivos já com extensão, então, para adicionar a extensão desejada somente aos sem, use a dupla: find + rename

find DIRETÓRIO -type f \! -name "*.*" -print | rename 's/(.+)/$1\.EXTENSÃO/'

Mais detalhes? Salve seu dia, consulte as man pages:

man rename
$ man find

Falou! ;)