Ares é Software Livre [RESOLVIDO]

Não, rapaz, não é só compilar.

Vamos usar o exemplo do bolo.

Você criou uma receita de bolo para ser feita em forma quadrada, de maneira que a calda de chocolate tivesse de ser posta enquanto o bolo está assando. Desta maneira, o chocolate derrete e entra no bolo, virando cobertura e recheio ao mesmo tempo.

Agora, vamos dizer que sua vizinha só tem forma redonda.
Será que da no mesmo ou a maneira como o chocolate vai escorrer, derretido em cima do bolo, mudará de trajetória?

O mesmo é com os programas feito especificamente para Linux ou Windows.
A começar pela interface gráfica (cobertura) que com Windows existe apenas uma app padrão disponível e no Linux temos QT, GTK, WXWidget...

comandos específicos do sistema? Tem de ser todos reescritos para fechar com o novo ambiente.

É muita modificação. O mesmo que querer pôr um motor de Dodge Viper num Chevette. Tem que fazer bastante coisa só pro motor encaixar, pra funcionar então... puts!