SED COMO EDITAR VÁRIAS LINHAS SIMULTÂNEAMENTE [RESOLVIDO]

buss
(usa Ubuntu)

Enviado em 27/01/2016 - 04:32h

Olá Fellas!

Estou tentando criar uma script para automatizar a formatação de 12 arquivos de aproximadamente 1 GB. Poderia fazer com o comando "vim", mas é muito trabalhoso e suscetíveis a erros.
Estas são os caracteres a serem substituídos:

Exemplos começo de linhas
x NE001357 0 0 1 -9 >> x NE001357 -9 -9 1 -9
x NE001358 0 0 1 -9 >> x NE001358 -9 -9 1 -9
x NE001359 0 0 1 -9 >> x NE001359 -9 -9 1 -9
x NE001360 0 0 1 -9 >> x NE001360 NE009990 78 1 2.2
x NE001361 0 0 1 -9 >> x NE001361 NE009980 478 1 3.4
x NE001362 0 0 1 -9 >> x NE001362 NE009911 23 1 6.1

Utilizei a seguinte sintaxe:
Substituir "foo" por "bar" somente as linhas que contém "plop"
sed '/plop/ s/foo/bar/g'

Formei o seguinte script:

sed '/NE001357/ 's/0 0 1 -9/-9 -9 1 -9/g' all_359.ped >> all_o

Este funcionou certinho para formatar a primeira linha, porém
qdo extrapolo para executar vários comandos ao mesmo tempo não funciona...

sed '/NE001357/ s/0 0 1 -9/-9 -9 1 -9/g' all_t >> all_o
sed '/NE001358/ s/0 0 1 -9/-9 -9 1 -9/g' all_t >> all_o
sed '/NE001359/ s/0 0 1 -9/-9 -9 1 -9/g' all_t >> all_o
sed '/NE001360/ s/0 0 1 -9/-9 -9 1 -9/g' all_t >> all_o
sed '/NE001361/ s/0 0 1 -9/-9 -9 1 -9/g' all_t >> all_o
sed '/NE001362/ s/0 0 1 -9/-9 -9 1 -9/g' all_t >> all_o

Eu gostaria de formatar todas as minhas 359 linhas ao mesmo tempo, sem formar um monte de arquivos intermediários.
Alguma ideia?

Abraços!

Carlos.

Brunorr
(usa CentOS)

Enviado em 27/01/2016 - 08:30h

Acredito que o que vc quer é que ele execute todos os comandos mas não altere a ordem no arquivo de origem. O que você pode fazer é utilizar o parâmetro "w" do comando sed. com este parâmetro você não precisa redirecionar a saída (>>) pois o comando substitui no próprio arquivo

NÃO ESQUEÇA DE FAZER BACKUP DO ARQUIVO ANTES


Dica: http://br.ccm.net/faq/8760-sed-introducao-ao-sed-part-i

msoliver
(usa Debian)

Enviado em 27/01/2016 - 09:24h

Bom dia Carlos.
As linhas sempre iniciam com: NE001357
Duas letras e seis números?

cat TST_buss.txt

NE001357 0 0 1 -9

NE001358 0 0 1 -9

NE001359 0 0 1 -9

NE001360 0 0 1 -9

NE001361 0 0 1 -9

NE001362 0 0 1 -9 

É isso que quer na saída?

NE001357-9-9 1 -9

NE001358-9-9 1 -9

NE001359-9-9 1 -9

NE001360-9-9 1 -9

NE001361-9-9 1 -9

NE001362-9-9 1 -9 

Att.:
Marcelo Oliver

buss
(usa Ubuntu)

Enviado em 27/01/2016 - 11:02h

Bom dia, MOLIVER.

Esté um arquivo binário .PED, output do software plink. Sendo que este cabeçalho que quero editar serve para identificar e adicionar informações a cada linha.

Todos os IDS são NE00xxxx (cada linha tem por este código uma identificação diferente).

as Linhas de origem estão nomeadas desta forma:

NE00xxxx 0 0 1 -9

Preciso substitui-las para caracteres númericos e alfanúmericos.
Por exemplo:

NE00xxxx -9 -9 1 -9

ou

NE00xxx NE1334 12354 1 2.34

buss
(usa Ubuntu)

Enviado em 27/01/2016 - 11:09h

Bom dia, Bruno... Vou testar! Sabe me dizer como ficaria a sintaxe da linha de comando?

sed '/NE001357/ s/0 0 1 -9/-9 -9 1 -9/g' all_t >> all_o
sed '/NE001358/ s/0 0 1 -9/-9 -9 1 -9/g' all_t >> all_o
sed '/NE001359/ s/0 0 1 -9/-9 -9 1 -9/g' all_t >> all_o
sed '/NE001360/ s/0 0 1 -9/-9 -9 1 -9/g' all_t >> all_o
sed '/NE001361/ s/0 0 1 -9/-9 -9 1 -9/g' all_t >> all_o
sed '/NE001362/ s/0 0 1 -9/-9 -9 1 -9/g' all_t >> all_o

Obrigado.

msoliver
(usa Debian)

Enviado em 27/01/2016 - 11:46h

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Bom dia buss.
OK, todas linhas começam com:
NE00xxxx
A variação ocorrerá somente nos xxxx e NE00 sempre fixo, é isso?
Sendo assim, a seguinte REGEX => NE00[0-9]\{4\} casa
Veja:

sed '/NE00[0-9]\{4\}/s/ 0/-9/g' TST_buss.txt  

NE001357-9-9 1 -9

NE001358-9-9 1 -9

NE001359-9-9 1 -9

NE001360-9-9 1 -9

NE001361-9-9 1 -9

NE001362-9-9 1 -9 

No exemplo que você postou, depois de NE00xxx, é sempre 0 0 1 -9.
É sempre assim mesmo, não há variação?

No aguardo,
Marcelo Oliver

buss
(usa Ubuntu)

Enviado em 27/01/2016 - 12:26h

Olá amigo.

O único problema é que NE00xxxx está na segunda coluna!

Ex: 14 NE00xxxx NE001383 4428 1 4.46

buss
(usa Ubuntu)

Enviado em 28/01/2016 - 15:24h

Olá Galera, consegui resolver a pendenga!!!

Vou dar o feedback ...

Seguinte o que estava dando pau era porque o "SED" só altera um caractere por vez, além disso,
eu tinha adicionado o g' no final isso tava multiplicando o tamanho do arquivo:

Ex do arquivo errado: sed '/IMAP5069/ s/ 0 0 1 -9/2222 3333 4444 555/g' arq_input <arq_saida

Vejam, não solucionei da maneira mais inteligente, mas da qual estava ao meu alcance: eu preciso formatar 12 arquivos, eu formatei o primeiro com o comando "VIM",
os 11 restantes o que muda do arquivo formatado primeiramente é só uma coluna.

Assim eu formei um script para editar somente uma coluna das quase 400 linhas dos 11 arquivos restantes:


sed '/IMAP5069/ s/1.60/36.57/' all_ge_backup |
sed '/IMAP5072/ s/1.60/35.50/' |
sed '/NE001403/ s/6.24/46.90/' |
sed '/NE001407/ s/3.24/53.50/' |
sed '/NE001408/ s/1.83/54.10/' |
sed '/NE001413/ s/3.03/48.90/' |
sed '/NE001416/ s/1.57/42.80/' |
sed '/NE001420/ s/3.82/50.10/' |
sed '/NE001423/ s/2.44/58.40/' |
sed '/NE001426/ s/3.09/47.20/' |
sed '/NE001427/ s/5.14/56.90/' |
sed '/NE001428/ s/5.58/54.70/' |
sed '/NE001429/ s/4.98/55.10/' |
sed '/NE001430/ s/2.96/51.30/' |
sed '/NE001438/ s/2.74/51.40/' |
sed '/NE001439/ s/3.38/53.60/' |
sed '/NE001440/ s/3.02/48.80/' |
sed '/NE003843/ s/2.20/40.57/' |
sed '/NE003845/ s/1.60/39.77/' |
sed '/NE003846/ s/1.60/33.80/' |
sed '/NE003961/ s/1.60/45.10/' > all_testsed

Gostaria de agradecer o MOLIVER e o Brunorr que se dedicaram para me ajudar a resolver o problema, economizarei uma semana de trabalho com este script! Valeu rapaziada!