Dica testada no Slackware 14.2, 64-bit.

Para indentar automaticamente um arquivo XML bagunçado há várias alternativas.

Uma delas é usando o script do Leo: Auto Ident XML [Perl]

Funciona que é uma beleza!

Outra forma é usando o xmlint:

xmllint --format original.xml > final.xml

Para isso instale o libxml2-utils. O xmllint pode dar erro em arquivos com nós grandes.

Outra forma seria:

xml_pp original.xml > final.xml

Mas para isso precisa do perl-xml-twig. Esse não trava com nós grandes.

Fica a dica!

Fonte: unix - How to pretty print XML from the command line? - Stack Overflow