O Expect é uma ferramenta que trabalha com a interação shell-usuário (pretendo explicar com mais detalhes em um artigo). É uma ferramenta sensacional, mas logo que comecei a trabalhar com ela me deparei com o seguinte problema:

A codificação do expect retorna dois caracteres de fim de linha: <CR> e <LF>, sendo assim eu não consegui fazer comparações com as variáveis. Por exemplo:

valor=`expect script.exp`
echo $valor
>>5

O script retornou o valor 5.

if [ `echo $valor` == "5" ];then
echo igual
else
echo diferente
fi
>>diferente

Tive que usar o `echo $valor`, pois o retorno é em texto e não em valor numérico. Mesmo a variável $valor estando igual a 5, o if não consegue comparar corretamente.

A solução encontrada para isso foi remover o caractere <CR> do fim da linha com o TR:

if [ `echo $valor | tr -d '\r' ` == "5" ];then
echo igual
else
echo diferente
fi
>>igual

Essa foi a ideia que tive para fazer funcionar, que serviu para o Expect, mas que pode servir para outros casos. Se alguém teve algum caso semelhante, com uma resolução diferente, podem postar aí.

Abraço.