Procure no VOL por fsck, que é o "chkdsk" do Linux.
Um exemplo:
http://www.vivaolinux.com.br/artigo/Checando-seu-sistema-de-arquivos-com-fsck
Note que há uma opção de fsck para cada tipo de sistema de arquivos (ext, reiser etc.), razão pela qual vc deve pesquisar um pouco.
Outro detalhe é que é melhor usar o fsck numa partição desmontada, ou seja, vc entra pelo Live CD do Ubuntu e então executa o fsck no seu HD.