Bom eu utilizo o ubuntu 11.10 com Gnome 3 e apanhei muito para configurar meu navegador com exceções de proxy, no firefox é tranquilo vc tem essa opção nas preferências do navegador, porém com o Chrome é outra história, uma vez que utiliza as mesmas configurações do sistema e essas configurações na interface gráfica não existe a possibilidade de adicionar as tais exceções de proxy que tanto necessitava.
Portanto tá aí a solução para quem estiver com o mesmo problema que eu tive.

Abra o terminal e use o comando:

gsettings set ESQUEMA[:CAMINHO] CHAVE VALOR

seguindo dessa maneira

gsettings set org.gnome.system.proxy ignore-hosts "['aqui coloque suas exceções']"

exemplo:

gsettings set org.gnome.system.proxy ignore-hosts "['localhost','127.0.0.1','10.*','10.0.0.1/8']"

Abraço!!!